Raquel Gutiérrez Aguilar estudió matemáticas en la Facultad de Ciencias en la UNAM. Participó durante casi dos décadas en las luchas sociales, populares y comunitarias en Bolivia, en particular, en el levantamiento conocido como Guerra del Agua en Cochabamba. Tras su regreso a México, hizo una maestría en filosofía en la UNAM y se doctoró en sociología por la BUAP.
Entre 2003 y 2013 compiló, junto a otras colegas, tres volúmenes de la serie Movimiento indígena en América Latina: resistencia y transformación social. Fue profesora-investigadora en el Instituto de Ciencias Sociales y Humanidades de la BUAP durante 13 años, donde fundó la línea de investigación "Entramados comunitarios y formas de lo político".
Entre sus publicaciones están los libros, Los ritmos del Pachakuti. Movilización y levantamiento indígena-popular en Bolivia (2000-2005) (2008) y Horizontes comunitario-populares. Producción de lo común más allá de las políticas estado-céntricas (2017).
Durante los últimos años ha colaborado con las luchas de las mujeres y disidencias en México y varios países de América Latina/Abya Yala, centrándose en la importancia de la transmisión intergeneracional de experiencia. Para ello ha impulsado la publicación de diversas obras que nutren los debates feministas en México y en otros países y publicado dos números de la serie Cartas a mis hermana más jóvenes, que han sido re-editadas en Guatemala, Bolivia, Uruguay y Argentina. Actualmente sostiene, junto a un colectivo transfronterizo, el semanario digital Ojala.mx y colabora con la librería y centro social Volcana en Ciudad de México.